Martinô Porres sinh tại thành Lima, nước Pêru, vào năm 1579. Cha là một hiệp sĩ Tây Ban Nha. Mẹ gốc người Panama, Mẹ của thánh nhân là một người nô lệ da đen được phóng thích gốc Phi Châu. Ngài có một em gái và cả hai là con ngoại hôn. Sau khi em gái ngài sinh ra, cha ngài đã bỏ rơi cả 3 mẹ con. Thoạt tiên, cha của Martinô chẳng cung cấp gì cho gia đình. Do vậy, họ đã sống rất nghèo khổ.